Окончил Александровскую гимназию в Риге (1886—1894), медицинский факультет Юрьевского университета (1899); ассистент клиники глазных болезней. В 1902—03 на военно-медицинской службе. Доктор медицины (1903, Юрьевский университет). В 1904—08 возглавлял глазную лечебницу в Звенигороде Киевской губ. С 1910 приват-доцент и одновременно с 1915  ассистент, в 1919—21 экстраординарный профессор глазной клиники Университета св. Владимира в Киеве. С 1922 жил в Латвии. Зав. кафедрой офтальмологии Латвийского университета в Риге, директор Клиники глазных болезней. Одновременно декан медицинского факультета (с 1923), ректор того же университета (1923—25). Основоположник латвийской научной школы офтальмологии и высшего образования в этой области медицины. Основатель Латвийского общества офтальмологов (1932).

Похоронен на кладбище в Риге.

Отец: Херман Юлий, предприниматель. Мать: Эмилия-Мария (ур. Шлессере). Братья: Бернхард (1877—1960), ветеринар; Арнольд (1885-?), юрист. Дочери: Кете (1907—1924); Карина. Сын: Бернхард (1903—1933).

Фотография персоны любезно предоставлена С. Ковальчук (Рига).

Библ.: Profesors Dr. med. Jānis Ruberts. Dzīve un darbs / Sast. S. Ranka. Rīga, 2007. L. 69—73.

Соч.: О заболеваниях глаз при проказе: дисс. на степень доктора медицины. Юрьев, 1903; Звенигородская глазная лечебница Попечительства Императрицы Марии Александровны о слепых и желательные в ней преобразования. Звенигородка, 1907; О действиях адреналина на внутриглазное давление // Вестник офтальмологии. 1908. Т. XXV, № 1. С. 3—46; Отчеты о деятельности Звенигородской глазной лечебницы за 1904-1907 г. Звенигород, 1908; О заболеваниях слезных канальцев при трахоме // Архив офтальмологии. 1929. Т. VI, ч. II, III. С. 160—166 (спец. вып.: Сборник статей, посвященных В.В. Чирковскому его друзьями ко дню 30-летия его научной деятельности (1899—1929 гг.); Экстракция катаракты в случае двустороннего микрофтальма с остатками эмбриональной ткани в передней камере и в стекловидном теле // Русский офтальмологический журнал.1929. № 10. С. 474—477 (спец. вып.: Сборник работ, посвящаемый профессору С.С. Головину друзьями, товарищами и учениками к сорокалетию его научно-врачебной деятельности, 1889—1929); Заметки по поводу лечения трахомы // Сборник в ознаменование сорокалетия научной деятельности заслуженного деятеля науки М.И. Авербаха. М.; Л., 1935. С. 400—405.

Лит.: Arnim M. Internationale Personalbibliographie 1800—1943. Stuttgart, 1952. Bd. 2. S. 449; Latvijas PSR mazā enciklopēdija. Rīga, 1970. 3.sēj. L. 245; Vīksna A. Jānis Ruberts: 1874—1934. Pa ārstu takām. Rīga, 1990; Макаренко I.М., Полякова I.М. Бiографiчний довiдник завiдувачiв кафедр та професорiв Нацiонального медичного унiверситету iменi О.О. Богомольця (1841—2001). Киïв, 2001. С. 138; Tankler H. Tartu University and Latvia: with an emphasis on relation in the 1920s and 1930s. Tartu, 2004. P. 83, 136, 142, 149; Profesors Dr. med. Jānis Ruberts. Dzīve un darbs / Sast. S. Ranka. Rīga, 2007.

Некр.: Kalniņš E. Universitātes bij. rektora prof. Dr. med. J. Ruberta piemiņai // Jaunākās Ziņas. 1934. 3. nov.; Jansons E. Profesors Jānis Ruberts † // Universitas. 1934. 15. nov. 237. lpp.